С 1911 г — церковно-приходская школа прошла следующие этапы исторического развития: 4-хлетняя, семилетняя, восьмилетняя и средняя школа.
1976 г. – средняя школа.
2001 г. — школа начала функционировать в новом, правда, приспособленном здании (Постановление главы администрации района об открытии Бахтайской средней школы от 12.09.2001г.)
2001 г. – Бахтайская средняя школа переименована в муниципальное общеобразовательное учреждение Бахтайская средняя общеобразовательная школа (Постановление главы администрации района №118 от 18.04.2001г.)
2006 г.- присвоен статус «Муниципальная экспериментальная площадка» по теме «Возрождение и развитие родного языка и национальной культуры бурятского народа».
2010 г. — присвоен статус «школа-лаборатория» по теме «Формирование и развитие образовательного пространства школы с этнокультурным компонентом» в рамках областного мегапроекта «Развитие инновационного потенциала образовательной деятельности как условие достижения нового качества образования».